Ⅰ 单倍型网络图TCS Network不显示traits怎么办
直接人工添加到上一步生成的.nex文件的最下方就可以了,生成后就显示了,用记事本打开.nex文件编辑,这个部分如字面意思,告诉软件数据的分组信息,PopART的输入文件是.nex格式文件,该文件主要包含两个部分内容:DATA和TRAITS,也就是序列信息和分组信息。单倍体型,是个体组织中,完全遗传自父母双方中某一亲本的一组等位基因。拥有特定SNP的个体常常在附近某一特定变异位点拥有特定等位基因,这种关系叫做连锁不平衡。简而言之,单体型就是指一段连锁的核酸序列。在单体型网络图中,不同的单体型就是用序列中的变异位点来区分。因此一般用来构建单体型的材料为:线粒体基因组、X/Y染色体,叶绿体基因组、或者是基因组上一段强连锁的区段。