如何找上下游通路網路葯理學

Ⅰ 如何在多路線路中查找通路

咨詢記錄 · 回答於2021-10-12

Ⅱ 如何確定某種因子在信號傳導通路的上游或下游

確定某種因子在信號傳導通路的上游或下遊方法：
將兩種因子A和B分別做基因沉默，沉默A gene 看看A和B表達的情況，然後沉默B gene 再看看A和B表達的情況。上游的因子被沉默表達後，下游的因子肯定表達下調或不表達。而下游因子被沉默表達後，上游因子的表達不會受影響。還可以做個免疫共沉澱，看看上游因子是不是直接結合（作用）於下游因子的基因啟動子區，開啟下游表達。如若不是，可能另有其他的環節在中間過程。

Ⅲ 網路葯理學可以與哪些技術結合

網路葯理學可以跟網路技術相結合，也就是在網路上的一些。軟體或者平台都可以跟網路葯理學進行相結合。因為在這幾年來，網路葯理學都是通過網路方法來分析葯物，靶點，還有就是和疾病之間的一些相互關系。

所以他具體的話就是可以跟網路的相關技術來進行相結合，也就是說在網路發達的今天，這些都是可以作為葯理學研究的一些工具。然後網路分析、網路方法都是其中的一些方法，然後網路葯理學就可以跟這些工具進行相結合來研究葯理學的這一門學科。

而且中醫是一個復雜的化學體系，是需要網路去記錄一些東西，然後來進行相關的研究的。所以網路葯理學就可以跟以上這些東西去進行相結合，然後開展研究。

Ⅳ 怎樣查找某個基因參與通路的上下游基因

pubmed上查文獻，一般文章中都會有基因上下游通路，或者與其編碼蛋白作用的蛋白。

Ⅳ 網路葯理學的介紹

網路葯理學是基於系統生物學的理論，對生物系統的網路分析，選取特定信號節點（Nodes）進行多靶點葯物分子設計的新學科。網路葯理學強調對信號通路的多途徑調節，提高葯物的治療效果，降低毒副作用，從而提高新葯臨床試驗的成功率，節省葯物的研發費用。

Ⅵ 如何通過分子生物學找下游的信號通路

您的問題太籠統了，代謝通路，信號傳導通路等等研究方法完全的不一樣；一般先經過生物信息學的方法確定您所研究物種中已經過驗證的通路，設計實驗思路後，然後再通過測序、轉染、蛋白質組等手段驗證假設。、

Ⅶ 什麼是系統葯理學

系統葯理學（Systems Pharmacology）是一種學科，它是多學科交叉的產物，包括經典葯理學、化學生物學、生物化學和結構生物學、基因組學、病理學，醫學以及應用數學、計算機技術、生物信息學等。
系統葯理學是多學科交叉的產物，包括經典葯理學、化學生物學、生物化學和結構生物學、基因組學、病理學，醫學以及應用數學、計算機技術、生物信息學和「－omics」方法，同時涵蓋了大量實驗學科包括從細胞、組織到器官的研究技術。系統葯理學被認為是未來轉化醫學的核心技術。
1.1 ADME/T評價與葯代計量學
葯物的吸收（absorption）、分布（distribution）、代謝（metabolism）及排泄（excretion）過程的是葯物發現進程中的一個重要進程。葯物分子進入機體，首先要克服ADME/T屏障，才可能是活性分子。這些分子和機體內的靶標結合進而產生葯效，葯物將會在網路水平以及器官整體水平上和機體發生相互作用。因此ADME/T 評價、葯物計量學、葯代計量學分析是葯物早起開發和化學分子成葯性的關鍵內容之一。
1.2 系統打靶和通路關聯
發現和闡明活性物質、發現靶標是葯物發現研究的核心。然而傳統的基於還原論的做法是通過分析化學手段獲取化學成分，採用分子生物學和生物化學技術開展實驗驗證，尋找可能的靶點。當前開展網路靶標預測、葯物-靶標關聯是多靶標葯物發現的新思路。
1.3 網路葯理學建模和分析
網路葯理學是從系統生物學，特別是從生物網路的角度研究疾病的發生發展過程、認識葯物與機體的相互作用並指導新葯發現。網路葯理學藉助高通量組學數據、分子網路數據以及計算機模擬分析，進而從靜態和動態角度研究葯物的作用機制和促進葯物創新。
1.4 多尺度系統整合
從系統水平，揭示葯物和生物系統內基因、蛋白質，以及生化網路等各組成之間，在時間次序和空間位置上的相互關系和系統動力學功能。從而在不同層次信息上理解生物系統的復雜生命行為，最終實現在給定條件下對生物系統的干預、改造和修復。

提出背景
編輯 語音
系統葯理學或系統葯物學（Systems Pharmacology）概念和術語提出於1992年4月在廣州召開了首屆全國中西醫學比較研討會，大會上曾邦哲（曾傑）提出了系統醫葯學（systems medicine and pharmacology）的概念和模型 [1] ，採用圖論和網路拓撲學方法，闡述了神經、內分泌、免疫與血管系統的機能活動與代謝器官的物質、能量代謝系統穩態模型，以及神經、內分泌與免疫細胞系統與基因、蛋白質、脂類等分子系統的雙向調控生命活動與發育的過程。
2008年，2012年，NIH連續舉辦了第一、二屆定量與系統葯理學（Quantitative and Systems Pharmacology, QSP） 研討會。兩次會議將學界、產業界與政府機構（包括FDA）中從事葯理學、系統生物學的專家們聚集起來討論未來葯物研發的新趨勢。會議的核心議題：是否能夠通過將系統生物學systems biology與葯理學pharmacology進行交叉，融合出一個新的學科---定量與系統葯理學（Quantitative and Systems Pharmacology, QSP），從而大大促進發現、開發和臨床應用治療葯物的進程？在經過後續一年多的斟酌、討論和咨詢後，終於《定量與系統葯理學白皮書》問世：Quantitative and Systems Pharmacology in the Post-genomic Era: New Approaches to Discovering Drugs and Understanding Therapeutic Mechanisms. 該成果標志著Systems Pharmacology新學科的誕生。

Ⅷ kegg如何查找乳酸菌通路

1、首先打開KEGG資料庫，你會進入下面這個界面，點擊KEGGPATHWAY。
2、紅框標識的是PATHWAY的一級分類，藍框框住的是二級分類。比如第一個Metabolismpathway的二級pathway已經列出來了。如果我想找細胞凋亡相關的通路，是有一個cellularprocess，很明顯我們的通路應該在這里。
3、點擊cellularprocess，頁面迅速的跳到這部分的二級pathway了，這時你可以看到二級通路下面更細化的通路，且確實有我們想要找的信息。以上kegg如何查找乳酸菌通路。

Ⅸ 如何找出某一個通路的所有基因

額，我談一下個人的看法吧。首先，就已知的數據來講，可以上資料庫直接搜索相關的通路。都會有列出來的。但如果你想發現未知的通路，那就不是一蹴而就的事情了。首先你可以通過大數據分析，比如晶元或轉錄組測序，推測兩個蛋白有關系（正相關還是反相關），然後再通過westerblot，或qPCR進一步驗證。之後，還需要用免疫共沉澱，酵母雙雜交等確定兩者是否有直接的相互作用，還是說是通過microRNA間接作用等等。一條通路的完善，是需要大批研究者的努力，積少成多。

Ⅹ 如何研究信號傳導通路請問研究某種受體或蛋白的下游信號傳導通路，實驗設計的一般方法，都有哪些謝謝

在KEGG或BioCarta這些pathway資料庫里找到你感興趣的通路，在pathway圖上找到你感興趣的蛋白後就能確認它的下游。實驗方法大體上就是上調（瞬時表達、mimics）或下調（Knockout、RNAi）你的Gene of Interest，再檢測下游的蛋白發生了上調還是下調，看看你的GOI和它們什麼聯系。