Ⅰ 單倍型網路圖TCS Network不顯示traits怎麼辦
直接人工添加到上一步生成的.nex文件的最下方就可以了,生成後就顯示了,用記事本打開.nex文件編輯,這個部分如字面意思,告訴軟體數據的分組信息,PopART的輸入文件是.nex格式文件,該文件主要包含兩個部分內容:DATA和TRAITS,也就是序列信息和分組信息。單倍體型,是個體組織中,完全遺傳自父母雙方中某一親本的一組等位基因。擁有特定SNP的個體常常在附近某一特定變異位點擁有特定等位基因,這種關系叫做連鎖不平衡。簡而言之,單體型就是指一段連鎖的核酸序列。在單體型網路圖中,不同的單體型就是用序列中的變異位點來區分。因此一般用來構建單體型的材料為:線粒體基因組、X/Y染色體,葉綠體基因組、或者是基因組上一段強連鎖的區段。